Параллельно главному герою приходится сталкиваться с бюрократией и внутренними противоречиями в структуре Коллегии. При попытках получить доступ к архивам для изучения истории серийных номеров малахириума Михаил встречает сопротивление со стороны сотрудников и начальства, что осложняет проведение расследования. Тем не менее он находит поддержку у коллег и продолжает работу над выяснением деталей.

В процессе событий Михаил сталкивается с внешними угрозами. К нему приходят представители рода Басмановых, которые ведут к нему преследование, пытаясь устранить как последнего представителя рода Скуратовых. Эта линия добавляет напряжённости и заставляет героя проявлять осторожность и решительность.

Основная сложность для Михаила заключается в объединении различных направлений расследования: анализу подделок, изучению архивных данных и личных связей управляющего, а также противостоянию опасным врагам. Он опирается на сведения от прислуги и документы, постепенно собирая пазл произошедших событий. Герой старается не только раскрыть заговор, но и понять мотивы тех, кто стоит за ним.

Развитие истории показывает, что Михаил действует последовательно, несмотря на препятствия и угрозы. Он использует как официальный ресурс Коллегии, так и внештатные способы сбора информации. Его решения направлены на установление истины и предотвращение новых инцидентов с малахириумом. Взаимоотношения с коллегами и фигурами из прошлого играют важную роль в развитии событий.

В итоге сюжет фокусируется на профессиональной и личной борьбе главного героя в сложных обстоятельствах службы и расследования. Михаил Скуратов оказывается в центре запутанной ситуации, где переплетаются официальные дела и опасные столкновения с врагами. История показывает его попытки сохранить порядок, разобраться в подноготной дела и защитить себя и свою семью в конфликте, в котором он оказался.